Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CbfbQ08024 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms