Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
AmbpQ07456 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
AmbpQ07456 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms