Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Atf4Q06507 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms