Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprgQ05909 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprgQ05909 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms