Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rcn1Q05186 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms