Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sox13Q04891 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sox13Q04891 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms