Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox8Q04886 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms