Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ccl7Q03366 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ccl7Q03366 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms