Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp11Q02853 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms