Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NfiaQ02780 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NfiaQ02780 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms