Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Muc1Q02496 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Muc1Q02496 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Muc1Q02496 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Muc1Q02496 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms