Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snai1Q02085 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snai1Q02085 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms