Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd1Q01822 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms