Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nme2Q01768 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme2Q01768 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme2Q01768 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme2Q01768 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme2Q01768 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme2Q01768 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme2Q01768 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme2Q01768 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme2Q01768 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nme2Q01768 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms