Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pde1bQ01065 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pde1bQ01065 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms