Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
VegfaQ00731 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms