Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gbp10Q000W5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp10Q000W5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms