Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scn1bP97952 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scn1bP97952 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms