Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfdP97946 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VegfdP97946 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfdP97946 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfdP97946 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfdP97946 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfdP97946 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfdP97946 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfdP97946 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfdP97946 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfdP97946 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfdP97946 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VegfdP97946 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfdP97946 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfdP97946 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfdP97946 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfdP97946 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VegfdP97946 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VegfdP97946 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VegfdP97946 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VegfdP97946 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VegfdP97946 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfdP97946 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfdP97946 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfdP97946 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfdP97946 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfdP97946 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfdP97946 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfdP97946 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfdP97946 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfdP97946 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfdP97946 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfdP97946 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfdP97946 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfdP97946 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfdP97946 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfdP97946 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfdP97946 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfdP97946 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VegfdP97946 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VegfdP97946 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfdP97946 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfdP97946 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfdP97946 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfdP97946 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfdP97946 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VegfdP97946 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfdP97946 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfdP97946 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfdP97946 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfdP97946 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfdP97946 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VegfdP97946 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VegfdP97946 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfdP97946 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VegfdP97946 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfdP97946 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfdP97946 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfdP97946 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VegfdP97946 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfdP97946 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfdP97946 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfdP97946 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfdP97946 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfdP97946 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfdP97946 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VegfdP97946 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfdP97946 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfdP97946 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfdP97946 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfdP97946 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfdP97946 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfdP97946 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfdP97946 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfdP97946 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfdP97946 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfdP97946 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfdP97946 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VegfdP97946 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VegfdP97946 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VegfdP97946 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VegfdP97946 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VegfdP97946 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VegfdP97946 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VegfdP97946 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VegfdP97946 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VegfdP97946 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VegfdP97946 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VegfdP97946 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
VegfdP97946 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VegfdP97946 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VegfdP97946 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
VegfdP97946 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VegfdP97946 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VegfdP97946 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VegfdP97946 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VegfdP97946 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VegfdP97946 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VegfdP97946 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VegfdP97946 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms