Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmklr1P97468 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms