Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ElocP83940 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ElocP83940 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ElocP83940 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ElocP83940 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ElocP83940 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ElocP83940 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ElocP83940 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ElocP83940 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ElocP83940 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ElocP83940 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ElocP83940 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ElocP83940 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ElocP83940 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ElocP83940 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ElocP83940 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ElocP83940 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ElocP83940 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ElocP83940 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ElocP83940 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ElocP83940 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ElocP83940 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ElocP83940 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ElocP83940 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ElocP83940 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ElocP83940 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ElocP83940 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ElocP83940 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ElocP83940 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ElocP83940 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ElocP83940 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ElocP83940 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ElocP83940 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ElocP83940 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ElocP83940 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ElocP83940 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ElocP83940 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ElocP83940 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ElocP83940 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ElocP83940 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ElocP83940 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ElocP83940 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ElocP83940 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ElocP83940 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ElocP83940 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ElocP83940 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ElocP83940 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ElocP83940 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms