Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gbx1P82976 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gbx1P82976 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms