Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gabpb2P81069 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gabpb2P81069 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms