Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad1P70340 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad1P70340 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad1P70340 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smad1P70340 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad1P70340 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad1P70340 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smad1P70340 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms