Protein–RNA interactions for Protein: P70269

Ctse, Cathepsin E, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtseP70269 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtseP70269 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtseP70269 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtseP70269 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtseP70269 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtseP70269 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtseP70269 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CtseP70269 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtseP70269 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtseP70269 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtseP70269 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtseP70269 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtseP70269 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtseP70269 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtseP70269 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtseP70269 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtseP70269 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtseP70269 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtseP70269 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtseP70269 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtseP70269 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtseP70269 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtseP70269 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtseP70269 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtseP70269 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtseP70269 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtseP70269 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtseP70269 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtseP70269 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtseP70269 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtseP70269 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtseP70269 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CtseP70269 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtseP70269 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtseP70269 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtseP70269 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtseP70269 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtseP70269 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtseP70269 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CtseP70269 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtseP70269 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtseP70269 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtseP70269 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.06■□□□□ 0
CtseP70269 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CtseP70269 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms