Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NficP70255 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NficP70255 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NficP70255 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NficP70255 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NficP70255 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NficP70255 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NficP70255 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NficP70255 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NficP70255 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NficP70255 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NficP70255 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NficP70255 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NficP70255 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NficP70255 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NficP70255 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NficP70255 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NficP70255 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NficP70255 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NficP70255 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NficP70255 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NficP70255 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NficP70255 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NficP70255 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NficP70255 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NficP70255 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NficP70255 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NficP70255 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NficP70255 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NficP70255 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NficP70255 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NficP70255 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NficP70255 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NficP70255 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NficP70255 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NficP70255 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NficP70255 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NficP70255 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NficP70255 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NficP70255 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NficP70255 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NficP70255 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NficP70255 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NficP70255 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NficP70255 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NficP70255 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NficP70255 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NficP70255 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NficP70255 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NficP70255 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NficP70255 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NficP70255 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NficP70255 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NficP70255 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NficP70255 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NficP70255 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NficP70255 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NficP70255 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NficP70255 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NficP70255 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NficP70255 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NficP70255 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NficP70255 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NficP70255 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NficP70255 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NficP70255 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NficP70255 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NficP70255 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NficP70255 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms