Protein–RNA interactions for Protein: P70195

Psmb7, Proteasome subunit beta type-7, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb7P70195 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb7P70195 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb7P70195 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb7P70195 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb7P70195 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb7P70195 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb7P70195 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb7P70195 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb7P70195 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb7P70195 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb7P70195 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb7P70195 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb7P70195 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb7P70195 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb7P70195 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb7P70195 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb7P70195 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb7P70195 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb7P70195 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb7P70195 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb7P70195 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb7P70195 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb7P70195 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb7P70195 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb7P70195 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms