Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SbdsP70122 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SbdsP70122 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SbdsP70122 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SbdsP70122 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms