Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Acta1P68134 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Acta1P68134 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Acta1P68134 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Acta1P68134 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Acta1P68134 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Acta1P68134 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms