Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl39P62892 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms