Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps28P62858 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Rps28P62858 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms