Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lsm3P62311 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lsm3P62311 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms