Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr2fP61219 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Polr2fP61219 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms