Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf3b6P59708 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf3b6P59708 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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