Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ctdsp1P58466 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ctdsp1P58466 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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