Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcstnP57716 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcstnP57716 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcstnP57716 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcstnP57716 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NcstnP57716 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NcstnP57716 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NcstnP57716 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms