Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd38P56528 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd38P56528 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd38P56528 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd38P56528 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd38P56528 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd38P56528 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd38P56528 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd38P56528 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd38P56528 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd38P56528 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd38P56528 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms