Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckbrP56481 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckbrP56481 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckbrP56481 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms