Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp5P56399 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp5P56399 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp5P56399 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp5P56399 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp5P56399 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp5P56399 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp5P56399 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp5P56399 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp5P56399 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp5P56399 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms