Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Faf1P54731 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Faf1P54731 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Faf1P54731 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Faf1P54731 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Faf1P54731 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Faf1P54731 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Faf1P54731 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Faf1P54731 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms