Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna1P52793 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna1P52793 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna1P52793 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna1P52793 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna1P52793 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Efna1P52793 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Efna1P52793 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms