Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClgnP52194 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClgnP52194 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ClgnP52194 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClgnP52194 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ClgnP52194 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClgnP52194 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ClgnP52194 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ClgnP52194 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms