Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ApodP51910 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ApodP51910 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApodP51910 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApodP51910 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApodP51910 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApodP51910 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApodP51910 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApodP51910 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApodP51910 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ApodP51910 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApodP51910 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ApodP51910 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApodP51910 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApodP51910 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ApodP51910 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ApodP51910 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ApodP51910 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ApodP51910 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ApodP51910 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ApodP51910 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ApodP51910 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ApodP51910 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ApodP51910 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ApodP51910 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ApodP51910 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ApodP51910 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ApodP51910 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ApodP51910 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ApodP51910 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ApodP51910 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ApodP51910 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ApodP51910 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ApodP51910 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ApodP51910 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ApodP51910 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ApodP51910 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ApodP51910 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms