Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa8P50706 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa8P50706 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa8P50706 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa8P50706 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms