Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TubP50586 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TubP50586 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TubP50586 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TubP50586 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TubP50586 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TubP50586 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TubP50586 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TubP50586 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TubP50586 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TubP50586 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TubP50586 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TubP50586 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TubP50586 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TubP50586 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TubP50586 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TubP50586 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TubP50586 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TubP50586 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TubP50586 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TubP50586 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TubP50586 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TubP50586 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TubP50586 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TubP50586 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TubP50586 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TubP50586 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TubP50586 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TubP50586 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TubP50586 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TubP50586 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TubP50586 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TubP50586 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TubP50586 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TubP50586 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TubP50586 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TubP50586 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TubP50586 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TubP50586 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TubP50586 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TubP50586 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TubP50586 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TubP50586 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TubP50586 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TubP50586 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TubP50586 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TubP50586 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TubP50586 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TubP50586 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TubP50586 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TubP50586 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TubP50586 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TubP50586 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TubP50586 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TubP50586 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TubP50586 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TubP50586 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TubP50586 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TubP50586 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TubP50586 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TubP50586 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TubP50586 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TubP50586 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TubP50586 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TubP50586 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TubP50586 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TubP50586 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TubP50586 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TubP50586 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TubP50586 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TubP50586 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TubP50586 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TubP50586 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TubP50586 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TubP50586 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TubP50586 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TubP50586 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TubP50586 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TubP50586 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TubP50586 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TubP50586 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TubP50586 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TubP50586 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TubP50586 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TubP50586 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TubP50586 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TubP50586 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TubP50586 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TubP50586 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TubP50586 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TubP50586 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TubP50586 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TubP50586 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TubP50586 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TubP50586 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TubP50586 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TubP50586 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TubP50586 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TubP50586 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TubP50586 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms