Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41P48193 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41P48193 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41P48193 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41P48193 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41P48193 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41P48193 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41P48193 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Epb41P48193 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms