Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg3P47867 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg3P47867 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg3P47867 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg3P47867 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Scg3P47867 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms