Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vps26aP40336 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vps26aP40336 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms