Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms