Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd1P40201 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chd1P40201 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chd1P40201 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd1P40201 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd1P40201 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd1P40201 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd1P40201 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd1P40201 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd1P40201 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd1P40201 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd1P40201 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd1P40201 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chd1P40201 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd1P40201 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chd1P40201 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms